Författare: Maria

  • Om borrelia i P4 Granskar

    Om borrelia i P4 Granskar

    För ett år sedan tog de upp borrelia i P4 Granskar, nu har de följt upp det igen.

    P4 Granskar: Borrelia

    Relaterade bilder:

  • Latjar med Drupal igen!

    Latjar med Drupal igen!

    Jag har en sida under utveckling där jag använder Drupal som CMS. Jag har hållit på med den sedan 2005 tror jag och den var klar att läggas ut med fin bild på Oliver som nyfödd någon gång runt 2006. Då kom det en uppgradering från Drupal 5 till Drupal 6 så jag satte mig och lekte med den uppgraderingen samtidigt som jag funderade på att ändra inriktningen lite på sidan. Jag insåg att alla roligt funktioner jag lagt till kanske inte var helt relevanta och att jag kanske borde lägga till några andra istället. Jag var faktiskt riktigt nöjd med hur det blev!!! Vid det laget hade jag börjat jobba skift, som sagt fått en ny bebis och började forskarstudier så hemsidan blev lite lagd åt sidan.

    Drupal 6
    Drupal 6. Sidan som inte fick se dagens ljus. Man får tänka bort ”dubbelexponeringen”, det såg normalt ut på normala sidor 🙂

    Så blev jag sjuk 2010. Jag vet att jag satt lite med den då, ville få till den så att jag kunde lägga ut den men jag orkade inte. Tappade koncentrationen och minnet. Det var ingen idé att börja eftersom jag inte kom ihåg var jag slutade. Det kan vara fatalt när man jobbar med CMSer. Att det kommer att krångla får man nästan räkna med, särskilt om man försöker sig på genvägar! Håller man inte reda på vad man gör eller hur långt man kommit så kan det bara sluta i katastrof.

    Häromdagen kände jag i alla fall att jag ville testa att uppgradera den gamla dammiga hemsidan, jag tror jag kan klara det nu. Nu har det dessutom funnits en version 7 av Drupal ett tag, så pass länge att den kan antas vara hyggligt stabil och värd att använda även för den som inte är så hugad att peta en massa php (i ärlighetens namn krävs det en del kunskap i php och diverse skript för att man alls ska ge sig på Drupal enligt min erfarenhet även om de försöker göra den allt mer intuitiv och användarvänlig). Drupals egen upgrade.txt-fil har en mycket bra steg-för-steg-instruktion för den som vill uppgradera från D6 till D7.

    Uppdatera moduler

    Det första man måste göra är att uppdatera alla moduler till senaste 6.x-versionen. Det gick väldigt lätt! Förut har det kunnat krångla om man missat någon detalj. Nu var det bara att byta ut gamla moduler mot nya och köra uppdateringsskriptet för varje ny modul.

    Gallra i moduler

    Sedan kan man, om man vill, kolla vilka moduler som finns för D7 och avgöra om det är värt en uppgradering. Flera vanliga tilläggsmoduler finns nu i kärnan och dessa kan tas bort på en gång. ”Sites”-mappen kan man i stort sett spara orörd, åtminstone när det gäller moduler, de kan vara bra att ha kvar så att man ser vilka det var man använder. Ett alternativ är att göra skärmdumpar eller skriva ner en lista över moduler och inställningar.

    När alla moduler är uppdaterade ska alla utom kärnmodulerna avaktiveras. Är det några man inte vill använda längre är det ett bra tillfälle att avinstallera dem och radera filerna nu. En del rekommenderar att tilläggsmodulerna raderas från filbiblioteket och att man bara spar det som finns i databasen men jag upptäckte att det är bra att ha kvar filerna eftersom de visas i modullistan så man ser vilka som behöver uppgraderas senare.

    CKEditor kom jag fram till bör avinstalleras INNAN uppgraderingen eftersom det inte går efteråt och vid uppgradering från D6 till D7 måste man göra en ominstallation. Notera eventuellt inställningar först!

    Gallra i teman

    Man måste byta tema till Garland innan uppgraderingen! D7 har helt andra kärnteman än D6 och det är bara Garland som finns kvar. Jag hade en modifierad version av Garland (med bebisen på) som sparade bilder och färgscheman lite varstans så det var inte bara att byta till Garland utan jag var tvungen att ändra färginställningar för temat innan Drupal fattade att jag inte använde mitt egenjusterade version. Det tog några försök innan jag kom på det! Då är man tacksam för bra backuper gjord i rätt tid.

    Teman som bygger på Garland kan ha en mapp som heter color i mappen där uppladdade filer sparas. Den måste tas bort för att Drupal ska förstå att det inställningarna från det egna temat inte gäller. Det kan vara lite trixigt, men det går om man byter tema fram och tillbaks och ändrar färginställningarna. Då fattar den till slut.

    Backup

    Gör en backup av både filbibliotek och databas! Det bästa är om man gör backuper med jämna mellanrum när man sedan uppgraderar tilläggsmoduler. Ju oftare desto mindre behöver man göra om – samtidigt som det finns en risk att det blir rörigt om man inte märker upp versionera noga!

    Följ instruktionerna i UPGRADE.txt

    Om man följer instruktionerna noga är det inga problem! Slarvar man eller inte läser så noga kan det däremot bli det.

    .htaccess och robots.txt kan vara anpassade, de måste bytas ut men behöver kanske ändras på samma sätt som i D6. Det tog några försök innan jag kom på att det berodde på det när jag fick vita sidor överallt utom på förstasidan. När jag avkommenterat
    RewriteBase /
    fungerade det igen. Det beror på att jag använder mig av subdomäner och då behöver man tala om att Drupal ska se sin egen root som den verkliga rooten.

    Kom ihåg att ändra till TRUE i settings.php på raden
    107 $update_free_access = FALSE;
    om du inte loggat in som admin av någon anledning. Kom ihåg att byta tillbaka när du är klar!

    Gör en ny backup

    När du uppgraderat kärnan kan det vara bra att göra en ny backup om det gått bra så här långt.

    Teckenkodning i databasen

    Minns inte när (och det är här det egentligen är bra med backuper så att man kan gå tillbaka) men ganska snart fick jag felmeddelandet
    Notice: unserialize() [function.unserialize]: Error at offset 14 of 15 bytes in variable_initialize() (line 916 of /min sökväg/includes/bootstrap.inc)
    Efter att ha sökt på nätet förstod jag att det kan bli krockar i teckenkodningen i databasen, om man till exempel har en kodning på databasen från början men råkar få en annan vid uppdateringen av kärna och/eller tilläggsmoduler så kan man få det felmeddelandet. Ibland kan man se var det blir fel genom att åäö och andra specialtecken ser konstiga ut, antingen på sidan eller i databasen. Mina gamla, ouppgraderade tabeller var kodade latin1_swedish_ci medan de nya fick utf8_general_ci. I settings.php kan man ställa in collation och ändra till den teckenkodning man föredrar. Jag har gjort ändringen men inte sett att det fungerar än. Tänkte installera några fler moduler för att se om felmeddelandena försvinner eller om de blir värre.

    Ett annat spår är att tabellen ”variable” är problemet, att variabler (BLOBs) för gamla, oanvända, moduler och teman plötsligt spökar. Jag testade att ta bort några rader för teman jag absolut inte använder men märkte ingen skillnad. Kan hända att moduler som inte uppgraderats ställer till det så jag väntar med att göra något åt det tills vidare. I värsta fall får jag börja om med min backup.

    Återkommer med resultat.

    Uppgradera tilläggsmoduler

    Om du sparat alla gamla moduler i /sites/all/modules (eller var du nu har dem) så kan du gå till modul-sidan och uppgradera dem en och en. Radera de gamla D6-modulfilerna innan du kopierar upp den nya versionen så det inte blir något skräp kvar som kan störa. Ta dem en och en, ibland finns det beroenden som gör att man måste hoppa lite, men gör det metodiskt. Kolla inställningarna för varje modul och testa så att de fungerar. Jag har inte hunnit kontrollera alla moduler än, men har hittills inte stött på några större problem.

    CCK

    CCK är ett kapitel för sig. Vissa av dess moduler ingår nu i kärnan så att man inte behöver uppgradera dem. Andra måste uppgraderas. Till hjälp finns det en uppgraderingsmodul för CCK i CCK-paketet. När man går till admin-sidan för uppgradering av CCK-fält är alla fält uppdelade i tre kategorier: Sådana som går att uppgradera, sådana som är uppgraderade och sådana som inte går att uppgradera. Går de att uppgradera är det bara att klicka i rutan och uppgradera, sedan hamnar de i listan över uppgraderade fält. Om de inte går att uppgradera står det (oftast) vilken modul som krävs för uppgradering, när den väl är installerad flyttas fälten upp till sådana som går att uppgradera, så är det bara att köra proceduren igen.

    Views

    Jag har inte riktigt kommit dit än, misstänker att det är en historia i sig. Det har varit så tidigare i alla fall. Återkommer.

    Relaterade bilder:

  • Osäkerheter kring artemisininresistens hos malaria

    I ett inlägg i American Journal of Tropical Medicine and Hygiene ifrågasätts larmrapporter om att malariaparasiten utvecklat resistens mot artemisinin på vissa håll i Asien. Dels finns det brister i de studier som gjorts, dels finns det alltid en viss andel resistens mot alla läkemedel. Ofta används artemisinin tillsammans med andra läkemedel för att i kombination slå ut malarian, de studier som publicerats koncentrerar sig på artemisinin och lämnar ut de andra läkemedel som används samtidigt. Kanske är det så att malarian utvecklar resistens mot det andra läkemedlet vilket gör att även artimisininet förlorar verkan.

    Relaterade bilder:

  • Julmusik på Spotify

    Julmusik på Spotify

    Jag har satt ihop en musiklista med julmusik.

    Kan inte låta bli att lägga till mer musik! Det finns så mycket bra, dålig och rolig julmusik! 🙂

    Relaterade bilder:

  • Nya borrelia-ringar = ny smitta

    En ny studie där man gjort DNA-analys på hudprover på patienter med Erythema migrans (EM = den klassiska ”borrelia-ringen”) visar att patienter som en gång behandlats för EM och kommer tillbaka med ett nytt EM har fått en ny infektion. Det kunde visas på så sätt att forskarna hittade borreliabakterier med ett lite annat DNA i märket än vid första insjuknandet.

    Detta är viktig information som inte får feltolkas. Vad studien visar är att man kan bli sjuk i borrelia flera gånger. Den visar också att det är troligt att man inte smittas av samma borrelia-stam – åtminstone när det gäller EM. Vad studien faktiskt inte visar är om andra symtom som kommer tillbaka efter en antibiotikabehandling beror på en ny infektion eller om det är symtom som beror på att alla bakterier inte dött under behandlingen och börjar växa igen.

    Jag vet inte riktigt vad forskarna ville visa egentligen. Jag trodde att de flesta (både IDSA- och ILADS-anhängare) var eniga om att EM är ett tidigt symtom på borrelia som sällan eller aldrig uppträder återkommande. Därför tycker jag det är lite förvirrande att de i sitt abstrakt för fram resultatet som om det vore något slags bevis för att alla återkommande borreliasymtom skulle vara nyinfektioner.

    Samtidigt är det bra att de visat att varje ny ring är en ny infektion så att den som drabbas kan få behandling på nytt!

    Hela artikeln kan läsas här:
    Differentiation of Reinfection from Relapse in Recurrent Lyme Disease N Engl J Med 2012; 367:1883-1890

    Relaterade bilder:

  • Sidan har blivit hackad

    Sidan har blivit hackad

    Var inne och kollade på sidan förrgår och skulle göra några uppdateringar. Då blev jag omdirigerad till en skum sida. Som tur var inte en riktig skum-sida utan bara Chrome (webbläsaren) som varnade om att något var fel. Jonas klurade på det över natten och det visade sig att någon tagit sig in på vår server!

    Relaterade bilder:

  • Bakslag

    Mår inte särskilt bra just nu. Varken fysiskt eller psykiskt. Fick tillbaka ett prov från Tyskland för ett par veckor sedan, det visade att jag hade högre nivåer av både fästingfebern och twaren. Jag har nog misstänkt det ända sedan slutet av augusti men då trodde jag att det kanske berodde på att jag var nervös inför arbetsträningen att jag inte mådde lika bra som tidigare. Att det ska vara så svårt att lita på sig själv och sin kropp!

    Sista helgen i september var jag med arbetskamraterna och vandrade i fjällen. Tyckte det gick ganska bra. På måndagen på jobbet var jag rätt mör. Sedan har jag bara blivit tröttare och tröttare. I början av oktober tog jag bort sulfan som jag ätit eftersom jag hittade info på CDCs hemsida om Ehrlichia. Där stod det att sulfa och fästingfeber inte går ihop. Man har sett att många blir sjukare efter en kur med sulfa och att i de fall någon dött har sulfa varit inblandat (även om de patienterna också var gamla och/eller hade andra sjukdomar och därför var försvagade redan innan).

    Mådde lite bättre efter det och nu i helgen mådde jag ganska bra och kunde vara med på båda Jonas födelsedagskalas. Nu i veckan har jag bara mått sämre igen. Har inte orkat ett dugg. Hjärtklappingen efter kaffe eller mat har kommit tillbaka, trycket över bröstet likaså. Jonas fick lov att hämta Oliver igår.

    Idag har jag varit piggare men haft ont i huvudet. Provade att skippa kaffet på förmiddagen för att slippa hjärtklappningen men fick lov att prova ett par koppar på eftermiddagen på grund av huvudvärken. Det hjälpte föga. Nu på kvällen funderar jag på om det kan vara någon förkylning på gång. Har ont åt bihålorna så att ögonen nästan tåras stundtals. Kanske var jag piggare i dag för att immunförsvaret triggats igång av något. Det ser jag som ett gott tecken mitt i allt elände. Än är inte immunförsvaret utslaget som jag tror till och från. Men man ska inte ropa hej…

    Relaterade bilder:

  • Fläcktyfus hos fästingar

    För den som väntar blir väntan lång, men så småningom kan vi kanske hoppas att den som smittats av en fästingburen sjukdom ska kunna få en riktig diagnos och en behandling som är värd namnet. Igår läste jag en artikel om att man funnit fläcktyfus hos 5-10% av de personer som sökte för borrelia i en svensk studie. Det hoppfulla är att forskarna som gjort studien är intresserade av att metoder för diagnos och behandling tas fram.

    Luras inte att tro att detta är något nytt, ändå! Redan i slutet av 1990-talet konstaterades att en person smittats av bakterien och dött. Det var en idrottsman som sjönk ihop efter en träning. Hur många gånger har vi inte läst om idrottsmän som dör just så. Oförklarligt. Till synes friska.

    Det är hög tid att fäsingburna sjukdomar accepteras. De finns! De är svårupptäckta! De kan vara svårbehandlade! Det går för det mesta att bota med antibiotika! Om man har tålamod!!!

    Fästingbitna kan ha smittats med tyfus Expressen 2012-09-18
    Peter, 19, dog av tyfus ”Berättelsen om vår sons sjukdom kan hjälpa andra” Aftonbladet 1999-10-17

     

    Relaterade bilder:

  • Rekordmånga drabbade av TBE | Nyheter | Expressen | Senaste nytt – Nyheter Sport Ekonomi Nöje

    Idag berättas det i flera medier att det är rekordmånga som drabbats av TBE i år. Är det någon som är förvånad. Egentligen? Fästingarna sprider sig över landet, med dem sjukdomarna de för med sig. MOT TBE finns det ett vaccin som man kan ta. Skyddet är inte 100%-igt men efter tre doser så gott som… Problemet är att det är ganska dyrt, särskilt om man vill vaccinera hela familjen (vem ska man annars välja bort!?) och vill underhålla doseringarna.

    Fästingfaran måste tas på allvar! Se till att vaccinera dig om du bor i eller nära riskområden eller om du planerar att resa dit. Du behöver inte ut i skogen för att få en fästing på dig!!! Det räcker att en katt eller mus strukit förbi blomkrukorna och släppt av en fästing!

    Rekordmånga drabbade av TBE | Nyheter | Expressen | Senaste nytt – Nyheter Sport Ekonomi Nöje.

    Relaterade bilder:

  • Trött dag

    Trött dag

    Idag har jag varit trött och haft ont i käken där tandläkaren borrade i benet. Var ändå med till Örebro för att köpa present till Edvin.

    På kvällen kom jag på att jag glömt geocacha idag, så jag valde att göra en utmaning, challenge, istället. Vet inte om det gäller som enomdan men det är värt ett försök och det känns bra att ha gjort något i alla fall.

    Det fick bli Fancy Framing (CX3731)

    Geocaching: FancyFraming
    Geocaching: FancyFraming, inramning av månen

    Relaterade bilder: